O enredo de Stone Ocean é baseado nas profecias apocalípticas de 2012 e introduz a única mulher "Jojo" como protagonista. Jolyne Kujo é filha de Jotaro e é uma menina delinquente que foi presa por assassinato, um crime que não havia cometido. Sua condenação e encaminhamento para a prisão Green Dolphin Street foram forjadas, dentro da prisão,

um amuleto entregue por seu pai ativa sua stand Stone Free e a partir daí luta para sobreviver contra os

outros detentos